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컴퓨터 기반 약물 설계를 위한 FlexX

FlexX는 도킹 중에 리간드 분자의 다양한 형태를 고려하는 빠르고 정확한 유연한 도킹 알고리즘입니다. FlexX는 먼저 리간드 분자에서 핵심 부분을 선택하여 수용체의 활성 부위에 도킹한 다음 트리 검색 방법을 통해 나머지 조각을 연결합니다. FlexX의 평가 기능은 향상된 결합 자유 에너지 기능을 채택합니다[4][5]. FlexX의 도킹 알고리즘은 단계별 구성 전략을 기반으로 하며 다음 세 단계로 나뉩니다. 첫 번째 단계는 코어 그룹이라고 하는 리간드의 연결 그룹을 선택하는 것입니다. 이때 리간드의 다른 부분은 고려하지 않고 마지막 단계를 구성이라고 하며, 이미 배치된 코어 그룹에 점차적으로 다른 그룹을 추가하여 완전한 리간드 분자를 구성합니다. FlexX는 일반적인 약물 분자를 도킹하는 데 약 3분이 소요되며 이는 중간 규모의 3차원 데이터베이스 검색에 사용될 수 있음을 나타냅니다. 또한 평가를 위해 경험적 결합 자유 에너지 함수를 사용하기 때문에 결과가 기반보다 더 나을 수 있습니다. 상호작용 에너지 평가 기능에 관한 분자 도킹 방법. 따라서 FlexX는 매우 유망한 약물 설계 방법입니다.

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