마가스는 고강도 신체 훈련을 좋아합니다. 재임 기간 동안 가장 유명한 훈련 방법은 '메디신 볼 훈련법'이었다. 그는 선수들에게 매우 큰 메디신 볼을 들고 다양한 근육에 대한 근력 훈련을 하라고 지시했다. 그는 또한 선수들이 독일 지역 숲에서 장거리 달리기를 하는 것을 좋아했습니다. 한번은 선수들이 목적지에 도착했을 때 선수들의 의지를 갈고 닦을 물을 제공하지 않았습니다.
이러한 코칭 스타일은 마가트에게 많은 비난을 불러일으켰다. 어떤 사람들은 그의 훈련 방식이 적극적인 달리기, 치열한 싸움, 끈질긴 의지를 팀에 가져왔다고 생각하지만 다른 사람들은 마가트의 훈련 방법이 반대라고 생각한다. 과학적인 내용이며 플레이어에게 부상을 입힐 수 있습니다. 이러한 훈련 분위기에서 마가트의 선수들은 코치의 훈련에 쉽게 혐오감을 느낄 수 있고 심지어 코치와 갈등을 빚기도 한다. 예를 들어 2010년 샬케 04 팀을 이끌던 시절 하피냐 선수는 훈련에 대해 비판을 받았다. .